醫院采用二氧化氯發生器來處理污水，醫院污水消毒目前國內外主要采用液氯、漂白粉（或漂白精）、次氯酸鈉、臭氧和二氧化氯等。用二氧化氯和氯氣對照處理醫院污水，進行消毒處理實驗。
1) 二氧化氯對國家規定的消毒劑鑒定菌種的殺滅效果是顯著和高效的，符合國家衛生部的規定要求。
2) 二氧化氯對醫院污水中分離鑒定出來的非致病菌和致病菌的消毒效果明顯好于液氯。
3) 二氧化氯可在ph=3.0-9.0范圍內有效殺滅醫院污水中的細菌（含大腸桿菌），而氯氣只有在中性條件下才達到滿意效果。
4) 二氧化氯對醫院污水中COD和BOD5的去除效果優于液氯。
醫院污水消毒是醫院污水處理的重要工藝過程，其目的是殺滅污水中的各種致病菌。醫院污水消毒常用的消毒工藝有氯消毒、氧化劑消毒、輻射消毒。
二氧化氯發生器在醫院污水中起到了重要作用，此款設備分為：化學法二氧化氯發生器以及電解法二氧化氯發生器?；瘜W法設備使用到的原料為鹽酸和氯酸鈉。而電解法使用的原料為工業鹽。運行成本較低。簡單操作，無需專人看管設備。
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